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目前尚不清楚,推测在胚胎8周前,内胚层管发育中断,导致断裂闭锁,8周后由于内胚层过长连接后形成隔膜,也有人认为与消化道空化过程异常有关,目前多数学者认为该病的病因与小肠闭锁与狭窄的病因相似,是在胚胎期.
前肠发育过程中腔化障碍所致,也有人认为可有血管发育畸形,梗死致胃坏死形成闭锁与狭窄;近年也有人通过胎儿镜活检,报道胎儿在宫内患有大疱表皮松解症,可能使幽门部黏膜受累形成瘢痕致幽门闭锁与狭窄,有人收集到81例,有家族性幽门闭锁,认为是常染色体隐性遗传病,4型中,最常见为幽门膜式闭锁或狭窄,其与幽门窦部膜式闭锁或狭窄一起又称胃内隔膜(gastric diaphragm),本节重点介绍此病.
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